สมาคมฟุตบอลฯ สั่งปรับ เมืองทองฯ 166,666 บาท พร้อมแบนจนจบฤดูกาล แถมต่อไปถึงปีหน้าอีก 5 นัด ด้าน ท่าเรือ เอฟซี โดนปรับ 133,333 บาท พร้อมแบนจนจบฤดูกาล หากปีหน้าทั้งสองทีมเจอกันห้ามแฟนบอลเข้าสนาม
จากกรณีเกิดเหตุแฟนบอลของสโมสร เอสซีจี เมืองทอง ยูไนเต็ด ปะทะกับแฟนทีม การท่าเรือ เอฟซี จนมีผู้ได้รับบาดเจ็บหลายราย ภายหลังจบเกมฟุตบอลโตโยต้า ลีก คัพ 2016 รอบรองชนะเลิศ นัดที่ 2 เมื่อวันพุธที่ 14 กันยายน 2559 ซึ่ง เอสซีจี เมืองทองฯ เป็นฝ่ายเอาชนะ 3-2 จากสกอร์รวม 2 นัด ผ่านเข้าไปชิงชนะเลิศกับ บุรีรัมย์ ยูไนเต็ด ในวันเสาร์ที่ 15 ตุลาคม 2559 ณ สนามศุภชลาศัย
โดยเมื่อเวลา 15.00 น. ของวันอังคารที่ 20 กันยายน 2559 ณ อาคารพงษ์สุภี คณะกรรมการพิจารณาวินัยมารยาท สมาคมฟุตบอลแห่งประเทศไทยฯ ที่มี พล.ต.ท.อำนวย นิ่มมะโน เป็นประธาน ได้เชิญตัวแทนทั้งสองสโมสร พร้อมด้วยนำหลักฐานต่าง ๆ มาเพื่อตัดสินพิจารณาถึงบทลงโทษจากเหตุวุ่นวายดังกล่าว
ซึ่งภายหลังการพิจารณาคณะกรรมการพิจารณาวินัยมารยาท ได้เปิดบทลงโทษต่อทั้งสองทีม โดยมีการสรุปบทลงโทษดังนี้
- ห้ามกองเชียร์ทั้งสองสโมสรเข้าเชียร์ทีมตัวเองจนจบฤดูกาลไม่ว่าจะจบกับใครจนจบฤดูกาล 2559 ทุกรายการที่สมาคมเป็นผู้จัด
- ในฤดูกาลหน้า เมืองทองฯ พบกับ ท่าเรือ ห้ามกองเชียร์ทั้งสองทีม เข้าชมเกมการแข่งขัน
- ปรับเงินในข้อบังคับ 4.1 ปรับ 33,333 บาท แต่คณะกรรมการสามารถเพิ่มโทษได้อีก ทั้งสองทีมถูกปรับเพิ่มอีก 1 แสนร่วมเป็น 133,333 บาท
- ลงโทษสโมสรเมืองทองฯ ห้ามจัดการแข่งขันในทุกรายการ เป็นจำนวน 5 นัดติดต่อกัน โดยให้ไปจัดการแข่งขันในสนามกลาง และให้เสนอแผนการจัดการรักษาความปลอดภัยในการจัดการแข่งขันขึ้นมาใหม่ ในนัดที่ 6 หากคณะกรรมการ พอใจก็จะสามารถจัดการแข่งขันต่อไปได้
- โทษปรับสโมสรเมืองทองฯในเรื่องการจัดการแข่งขันอีก 33,333 บาท รวมแล้ว สโมสรเมืองทองฯถูกปรับ 166,666 บาท
นอกจากนี้ จะมีการตามหาแกนนำทะเลาะวิวาทมาดำเนินคดี ถ้าไม่ให้ความร่วมมือจะออกหมายจับ
ซึ่งทำให้การแข่งขันฟุตบอลช้าง เอฟเอคัพ รอบ 8 ทีมสุดท้าย ที่เอสซีจี เมืองทอง จะเปิดบ้านพบกับ ชลบุรี เอฟซี ใช้สนามกลาง โดยจะใช้สนามราชมังคลากีฬาสถานในการแข่งขัน