มารยาททางสังคมเป็นสิ่งสำคัญมากในสังคมญี่ปุ่น แม้กฎบางข้ออาจเป็นสิ่งที่ถือปฏิบัติกันเป็นสากล แต่บางข้อก็เป็นลักษณะเฉพาะของสังคมญี่ปุ่นซึ่งผู้ที่มาจากวัฒนธรรมที่ต่างกันควรเคารพ
สำหรับมารยาทในการใช้บ่อน้ำร้อนแบบญี่ปุ่นที่ยูโนะโมริ ออนเซนฯ มีดังนี้
1.ถอดเสื้อผ้าออกให้หมดในห้องเปลี่ยนเสื้อผ้า นำมาเก็บไว้ในล็อกเกอร์ นำติดตัวไปเฉพาะผ้าขนหนูผืนเล็กที่เตรียมไว้ให้เท่านั้น
2.ชาวญี่ปุ่นนิยมแช่น้ำโดยไม่สวมใส่สิ่งใด ออนเซนส่วนใหญ่จึงห้ามสวมชุดว่ายน้ำ เว้นแต่จะจัดเตรียมไว้ให้ อย่างไรก็ตามสามารถนำผ้าขนหนูผืนเล็กเข้าไปในบริเวณบ่อน้ำร้อนได้ โดยอาจใช้ปกปิดบางส่วนของร่างกายในขณะที่ไม่ได้อยู่ในบ่อน้ำร้อน
3.ก่อนลงบ่อน้ำร้อน ต้องอาบน้ำทำความสะอาดร่างกายที่บริเวณอาบน้ำ ซึ่งจะมีม้านั่งตัวเตี้ย ก๊อกน้ำร้อน-น้ำเย็น และฝักบัวเตรียมไว้ให้ ทำความสะอาดร่างกายทุกส่วนด้วยสบู่และผ้าขนหนูผืนเล็ก เมื่อล้างตัวจนสะอาดแล้วให้ซักผ้าขนหนูให้สะอาดปราศจากฟองสบู่
4.เนื่องจากบ่อน้ำร้อนมีอุณหภูมิสูงตั้งแต่ 40-44 องศาเซลเซียส จึงควรหย่อนร่างกายลงในบ่อน้ำร้อนอย่างช้าๆ เมื่อลงไปทั้งตัวแล้วควรเคลื่อนไหวให้น้อยที่สุดเพื่อดื่มด่ำกับคุณค่าจากบ่อน้ำร้อนอย่างเต็มที่
5.ห้ามนำผ้าขนหนูผืนเล็กลงไปในบ่อน้ำร้อน ให้วางไว้ข้างบ่อ
6.ห้ามทำความสะอาดร่างกายในบ่อน้ำร้อน ควรทำความสะอาดร่างกายให้เรียบร้อยตั้งแต่ในบริเวณอาบน้ำ
7.ห้ามส่งเสียงดังหรือร้องเพลงขณะแช่น้ำ พูดคุยกันให้น้อยที่สุดด้วยเสียงเบา
8.ห้ามปัสสาวะลงในบ่อน้ำร้อน
9.ลูกค้าสามารถใช้บ่อน้ำได้ทุกชนิด และลงแช่ได้มากกว่า 1 ครั้ง
10.หากต้องการลงแช่น้ำร้อนหลังการใช้ซาวน่าหรือห้องอบไอน้ำ ควรทำความสะอาดร่างกายก่อน
11.เมื่อเสร็จจากการแช่น้ำ ให้ทำความสะอาดร่างกายในบริเวณอาบน้ำและรักษาความสะอาดเรียบร้อยหลังการใช้งาน
12.เช็ดตัวด้วยผ้าขนหนูผืนเล็กก่อนเข้าสู่ห้องเปลี่ยนเสื้อผ้า