รัฐบาลญี่ปุ่นจะอนุญาตให้ชาวต่างชาติจากทุกประเทศที่มีวีซ่าพำนักตั้งแต่ 3 เดือนขึ้นไปเข้าประเทศญี่ปุ่นได้ตั้งแต่เดือนตุลาคมเป็นต้นไป แต่ยังห้ามนักท่องเที่ยวเดินทางเข้าประเทศ
ผู้ที่จะเดินทางเข้าประเทศญี่ปุ่นจะต้องได้รับวีซ่าที่อยู่ในญี่ปุ่นตั้งแต่ 3 เดือนขึ้นไป เช่น นักศึกษา ผู้ฝึกงาน ธุรกิจ คู่สมรส ผู้ติดตาม รวมทั้งวีซ่าทำงาน โดยกำหนดโควต้าเข้าประเทศวันละ 1,000 คน และจะต้องกักตัวเป็นเวลา 14 วัน ห้ามใช้ระบบขนส่งสาธารณะในการเดินทาง
ผู้ที่ต้องการเดินทางเข้าญี่ปุ่นโปรดตรวจสอบคุณสมบัติของตน และต้องยื่นขอวีซ่าหรือเอกสารอนุญาตเดินทางเข้าญี่ปุ่นจากสถานทูตญี่ปุ่น
นับตั้งแต่เกิดการรบาดของไวรัสโควิด ญี่ปุ่นห้ามประชาชนจาก 159 ประเทศและดินแดนเดินทางเข้าญี่ปุ่น แม้แต่ชาวญี่ปุ่นในต่างประเทศ คู่สมรสและครอบครัว รวมทั้งนักศึกษาและผู้ที่มีบัตรอนุญาตพำนักในญี่ปุ่นอยู่แล้วแต่เดินทางออกไปนอกประเทศ ก็ไม่สามารถกลับเข้าญี่ปุ่นได้
จนกระทั่งเดือนกรกฎาคม รัฐบาลญี่ปุ่นได้ผ่อนคลายข้อจำกัดการเดินทางเข้าญี่ปุ่นให้กับ 16 ประเทศ รวมทั้ง ประเทศไทย แต่ก็ยังมีข้อจำกัดคือ ต้องเป็นผู้ที่มีสถานะพำนักในญี่ปุ่นอยู่ก่อนแล้ว มีความจำเป็นด้านมนุษยธรรม หรือติดต่อธุรกิจ โดยนักศึกษาต่างชาติหรือคนทำงานที่เข้าญี่ปุ่นเป็นครั้งแรกยังไม่สามารถเดินทางเข้าญี่ปุ่นได้ ยกเว้นนักศึกษาที่ได้รับทุนจากรัฐบาลเท่านั้น
ในเดือนตุลาคม รัฐบาลญี่ปุ่นจะพิจารณาการอนุญาตให้ผู้ที่มีสถานะพำนักอาศัยในญี่ปุ่นทั้งระยะกลางและระยะยาว จากทุกประเทศ สามารถเดินทางเข้าญี่ปุ่นได้ รวมทั้งจะเปิดรับนักศึกษาชาวต่างชาติที่จะเดินทางมาญี่ปุ่นด้วยค่าใช้จ่ายของตนเองด้วย อย่างไรก็ตาม นักท่องเที่ยวทั้งหมดยังห้ามเข้าประเทศญี่ปุ่น.