นายสรพงศ์ ไพฑูรย์พงษ์ รองปลัดกระทรวงคมนาคม ในฐานะประธานอำนวยการบริหารจัดการแก้ไขสถานการณ์โควิดในระบบขนส่งมวลชน กล่าวว่า วันที่ 14 มิ.ย. 2564 "ศูนย์ฉีดวัคซีนกลางบางซื่อ (Central Vaccination Center) ณ สถานีกลางบางซื่อ จะเริ่มมีการฉีดวัคซีนโควิด-19 เข็มที่ 2 ให้แก่กลุ่มเป้าหมาย เป็นบุคลากรด้านคมนาคมขนส่ง รถรับจ้างสาธารณะต่างๆ ในสังกัดกระทรวงคมนาคม และบุคคลที่เกี่ยวข้องกับการทำงานของกระทรวงคมนาคม ได้แก่ กลุ่มบุคคลที่ทำความสะอาดสถานที่ราชการ กลุ่มพนักงานรักษาความปลอดภัยในพื้นที่กรุงเทพฯ และปริมณฑล
ซึ่งได้จัดเตรียมพื้นที่บริเวณโถงประตู 1 ของสถานีกลางบางซื่อไว้รองรับ โดยมีบุคลากรจากกรมการขนส่งทางบก (ขบ.) คอยดูแล อำนวยความสะดวกแก่ประชาชนในจุดบริการเข็ม 2
ส่วนกลุ่มรับวัคซีนเข็ม1 ประเภทองค์กร และกลุ่มที่ลงทะเบียนจองคิวฉีดวัคซีนโควิดผ่านผู้ให้บริการโทรศัพท์เคลื่อนที่ทั้ง 4 ราย ได้แก่ AIS, TRUE, DTAC และ บริษัทโทรคมนาคมแห่งชาติ จำกัด (มหาชน) หรือ NT จะใช้พื้นที่ตั้งแต่ประตู 2-4 รองรับ ซึ่งจะไม่ปะปนกันกับผู้เข้ารับเข็มที่ 2