การรถไฟแห่งประเทศไทย (รฟท.) เปิดเดินรถสายเหนือ ขบวนรถจากกรุงเทพฯ-เชียงใหม่ จำนวน 2 ขบวน คือ ขบวนรถด่วนพิเศษดีเซลรางที่ 9 กรุงเทพฯ-เชียงใหม่ ออกจากกรุงเทพฯ เวลา 08.30 น. และขบวนรถด่วนพิเศษ นครพิงค์ที่ 1 กรุงเทพฯ-เชียงใหม่ ออกจากกรุงเทพฯ เวลา 18.10 น. โดยเดินรถเลี่ยงทางรถไฟที่ถูกน้ำท่วมไปทางมักกะสัน ฉะเชิงเทรา หัวหมาก คลอง 19 แก่งคอย และย้อนกลับไปทางชุมทางบ้านภาชี ก่อนเดินรถต่อไปทางสายเหนือ
ส่วนเที่ยวกลับจากเชียงใหม่-กรุงเทพฯ จำนวน 2 ขบวน คือ ขบวนรถด่วนพิเศษดีเซลราง 12 เชียงใหม่ - กรุงเทพฯ ออกจากเชียงใหม่ เวลา 08.45 น. และขบวนรถด่วนพิเศษนครพิงค์ที่ 2 เชียงใหม่ - กรุงเทพฯ ออกจากเชียงใหม่ เวลา 17.55 น. ซึ่งเดินรถเลี่ยงทางน้ำท่วมเช่นกัน
ทั้งนี้ ขบวนรถสายเหนือขบวนอื่นๆ เดินรถต้นทางที่ชุมทางบ้านภาชี-เชียงใหม่ ชุมทางบ้านภาชี จำนวน 14 ขบวน
ขณะที่สายใต้ สามารถเดินขบวนรถเร็ว รถด่วนพิเศษ รวม 4 ขบวน โดยผ่านจุดน้ำท่วมไปยังปลายทาง ซึ่งต้องเริ่มต้นทางและปลายทางที่สถานีนครปฐม เนื่องจากน้ำท่วมรางรถไฟช่วงระหว่างสถานีบางบำหรุถึงศาลายา ทำให้ขบวนรถไม่สามารถออกต้นทางที่สถานีหัวลำโพงได้
ทั้่งนี้ การรถไฟฯ ได้จัดรถยนต์อำนวยความสะดวกให้กับผู้โดยสาร เพื่อเดินทางกลับเข้ากรุงเทพฯ ต่อไป ส่วนรถไฟสายใต้ฝั่งธนบุรี เปลี่ยนต้นทางเป็นสถานีนครปฐมเช่นกัน
นอกจากนี้ การรถไฟฯ จัดเดินรถช่วยการโดยสารในการบรรเทาความเดือดร้อนประชาชนที่อาศัยอยู่ในเขตชานเมือง ประชาชนที่ต้องการเดินทางในระยะสั้นๆ ขณะนี้สามารถเดินได้ระหว่างกรุงเทพฯ-หลักสี่ จำนวน 22 ขบวน กรุงเทพฯ-บางเขน จำนวน 5 ขบวน กรุงเทพฯ-หัวตะเข้ จำนวน 1 ขบวน และกรุงเทพฯ-นครปฐม จำนวน 2 ขบวน
สำหรับผู้โดยสารที่ไม่สามารถเดินทางได้ ติดต่อขอรับเงินคืนได้เต็มราคา ที่นายสถานีรถไฟทุกแห่ง หรือสอบถามรายละเอียดการเดินทางได้ที่ศูนย์บริการลูกค้าสัมพันธ์ หมายเลข 1690 ตลอด 24 ชั่วโมง
ส่วนเที่ยวกลับจากเชียงใหม่-กรุงเทพฯ จำนวน 2 ขบวน คือ ขบวนรถด่วนพิเศษดีเซลราง 12 เชียงใหม่ - กรุงเทพฯ ออกจากเชียงใหม่ เวลา 08.45 น. และขบวนรถด่วนพิเศษนครพิงค์ที่ 2 เชียงใหม่ - กรุงเทพฯ ออกจากเชียงใหม่ เวลา 17.55 น. ซึ่งเดินรถเลี่ยงทางน้ำท่วมเช่นกัน
ทั้งนี้ ขบวนรถสายเหนือขบวนอื่นๆ เดินรถต้นทางที่ชุมทางบ้านภาชี-เชียงใหม่ ชุมทางบ้านภาชี จำนวน 14 ขบวน
ขณะที่สายใต้ สามารถเดินขบวนรถเร็ว รถด่วนพิเศษ รวม 4 ขบวน โดยผ่านจุดน้ำท่วมไปยังปลายทาง ซึ่งต้องเริ่มต้นทางและปลายทางที่สถานีนครปฐม เนื่องจากน้ำท่วมรางรถไฟช่วงระหว่างสถานีบางบำหรุถึงศาลายา ทำให้ขบวนรถไม่สามารถออกต้นทางที่สถานีหัวลำโพงได้
ทั้่งนี้ การรถไฟฯ ได้จัดรถยนต์อำนวยความสะดวกให้กับผู้โดยสาร เพื่อเดินทางกลับเข้ากรุงเทพฯ ต่อไป ส่วนรถไฟสายใต้ฝั่งธนบุรี เปลี่ยนต้นทางเป็นสถานีนครปฐมเช่นกัน
นอกจากนี้ การรถไฟฯ จัดเดินรถช่วยการโดยสารในการบรรเทาความเดือดร้อนประชาชนที่อาศัยอยู่ในเขตชานเมือง ประชาชนที่ต้องการเดินทางในระยะสั้นๆ ขณะนี้สามารถเดินได้ระหว่างกรุงเทพฯ-หลักสี่ จำนวน 22 ขบวน กรุงเทพฯ-บางเขน จำนวน 5 ขบวน กรุงเทพฯ-หัวตะเข้ จำนวน 1 ขบวน และกรุงเทพฯ-นครปฐม จำนวน 2 ขบวน
สำหรับผู้โดยสารที่ไม่สามารถเดินทางได้ ติดต่อขอรับเงินคืนได้เต็มราคา ที่นายสถานีรถไฟทุกแห่ง หรือสอบถามรายละเอียดการเดินทางได้ที่ศูนย์บริการลูกค้าสัมพันธ์ หมายเลข 1690 ตลอด 24 ชั่วโมง