ศาลปกครองกลางมีคำสั่งยกคำร้องของ 30 บริษัทในโครงการนิคมอุตสาหกรรมมาบตาพุด ที่ขอยกเว้นคำสั่งคุ้มครองชั่วคราว เพราะเกิดก่อน รธน.ปี 50 โดยศาลเห็นว่า ผู้ร้องทั้งหมดสามารถใช้หลักฐานที่ตรวจสอบจากสำนักนโยบายและแผนทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมได้ จึงไม่อยู่ภายใต้ข้อบังคับของคำสั่งคุ้มครองชั่วคราวก่อนการพิพากษาของศาลปกครองกลางเมื่อวันที่ 29 ก.ย.52 และคำสั่งศาลปกครองสูงสุดวันที่ 2 ธ.ค.52 ศาลจึงไม่จำเป็นต้องวินิจฉัย
หลังโครงการอุตสาหกรรมทั้ง 30 แห่ง ยื่นคำร้องขอให้ศาลปกครองมีคำสั่งยกเว้นคำสั่งคุ้มครองชั่วคราวของศาลปกครองกลางและศาลปกครองสูงสุด ที่ห้ามดำเนินโครงการใดๆ เนื่องจากกระทบต่อสิ่งแวดล้อม โดยอ้างเหตุผลเป็นโครงการที่ได้รับอนุญาตจากผู้เชี่ยวชาญการวิเคราะห์ผลกระทบสิ่งแวดล้อมก่อนวันประกาศบังคับใช้รัฐธรรมนูญ 2550 และไม่เกิดผลกระทบต่อชุมชน
ในที่สุดศาลได้มีคำสั่งยกคำร้องดังกล่าว เนื่องจากเห็นว่า ผู้ร้องทั้งหมดสามารถใช้หลักฐานที่ตรวจสอบจากสำนักนโยบายและแผนทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมได้ จึงไม่อยู่ภายใต้ข้อบังคับของคำสั่งคุ้มครองชั่วคราวก่อนการพิพากษาของศาลปกครองกลางเมื่อวันที่ 29 กันยายน 2552 และคำสั่งศาลปกครองสูงสุดวันที่ 2 ธันวาคม 2552 ศาลจึงไม่จำเป็นต้องวินิจฉัย และมีคำสั่งให้ยกคำร้อง
