ฮอนด้า WR-V ถูกเปิดตัวพร้อมวางจำหน่ายที่ญี่ปุ่น ดีไซน์ถอดแบบจาก "ฮอนด้า Elevate" ที่อินเดีย ติดตั้งเครื่องยนต์เบนซิน 1.5 ลิตร กำลังสูงสุด 118 แรงม้า ราคาเริ่มต้นเพียง 2,098,800 เยน หรือราว 5.1 แสนบาทเท่านั้น
ฮอนด้า WR-V ที่วางจำหน่ายในประเทศญี่ปุ่นถูกพัฒนาขึ้นบนพื้นฐานของ "Fit/Jazz" รุ่นปัจจุบัน โดยอิงดีไซน์ของ "ฮอนด้า Elevate" ที่วางจำหน่ายในอินเดียซึ่งแตกต่างไปจากเวอร์ชันไทยอย่างสิ้นเชิง มีให้เลือกทั้งหมด 3 รุ่นย่อย คือ X, Z และ Z+ เคาะราคาจำหน่ายระหว่าง 2,098,800 - 2,489,300 เยน หรือประมาณ 510,000 - 600,000 บาทเท่านั้น ตั้งเป้ายอดจำหน่าย 3,000 คันต่อเดือน
เวอร์ชันญี่ปุ่นติดตั้งเครื่องยนต์เบนซิน 4 สูบ ขนาด 1.5 ลิตร กำลังสูงสุด 118 แรงม้า ที่ 6,600 รอบต่อนาที แรงบิดสูงสุด 142 นิวตัน-เมตร ที่ 4,300 รอบต่อนาที ส่งกำลังไปยังล้อคู่หน้าด้วยเกียร์อัตโนมัติ CVT และมีอัตราสิ้นเปลืองเฉลี่ย 16.4 กม./ลิตร (ตามมาตรฐาน WLTC)
ภายนอกถูกติดตั้งไฟหน้าแบบ LED พร้อมกระจังหน้าขนาดใหญ่ ด้านท้ายติดตั้งไฟท้ายแบบ LED ที่ออกแบบให้มีแถบเชื่อมไฟทั้งสองข้างเข้าไว้ด้วยกัน พร้อมล้ออัลลอยขนาด 16 นิ้ว หรือ 17 นิ้ว ขึ้นอยู่กับรุ่นย่อย มีความสูงจากพื้นถนนอยู่ที่ 195 มม. ซึ่งฮอนด้าระบุว่าสูงที่สุดเมื่อเทียบกับรถพิกัดเดียวกัน รองรับการขับขี่บนทางขรุขระได้ดี
ภายในห้องโดยสารติดตั้งหน้าจอแสดงข้อมูลการขับขี่แบบ TFT LCD ขนาด 7 นิ้ว พร้อมมาตรวัดความเร็วแบบอนาล็อก สามารถเลือกติดตั้งหน้าจออินโฟเทนเมนท์แบบสัมผัสขนาด 9 นิ้ว จากแบรนด์ Gathers พร้อมฟังก์ชันเชื่อมต่อ Honda CONNECT โดยจะถูกติดตั้งลอยตัวขึ้นจากแผงคอนโซลเพื่อความสะดวกในการมองเห็น รวมถึงติดตั้งระบบปรับอากาศอัตโนมัติพร้อมช่องแอร์สำหรับแถวหลังมาให้
นอกจากนี้ WR-V เวอร์ชันญี่ปุ่นยังถูกติดตั้งระบบความปลอดภัย Honda SENSING ที่มีถึง 13 ฟังก์ชัน เช่น ระบบป้องกันการชน Collision Mitigation Braking System (CMBS), ระบบช่วยหักหลบคนเดินถนน Pedestrian Collision Mitigation Steering System, ระบบป้องกันรถตกถนน Road Departure Mitigation (RDM) System, ระบบควบคุมความเร็วแปรผันอัตโนมัติ Adaptive Cruise Control (ACC) เป็นต้น
