ญี่ปุ่นเผชิญฝนตกหนัก พื้นที่โอซากา เกียวโตพระพิรุณกระหน่ำ โรงเรียนสั่งหยุดเรียน ระบบคมนาคมบางส่วนถูกระงับ นครเกียวโตอพยพชาวบ้านกว่า 160,000 คน หลังมีผู้สังเวยชีวิตแล้ว 1 ราย
สำนักอุตุนิยมวิทยาของญี่ปุ่นเตือนว่าจะมีฝนตกมากเป็นประวัติการณ์ในหลายพื้นที่ของญี่ปุ่น โดยจะมีฝนตกต่อเนื่องและฝนตกเป็นช่วง ๆ ไปจนถึงวันอาทิตย์ที่ 8 กรกฎาคม
พื้นที่ซึ่งได้รับผลกระทบมากที่สุด คือ ภูมิภาคคันไซ นครโอซากาและเกียวโตมีฝนตกหนักจนทางการท้องถิ่นประกาศเตือนภัยระดับสีแดงตั้งแต่เมื่อวานนี้ ส่งผลให้โรงเรียนในพื้นที่ประกาศงดการเรียนการสอน รถไฟและบริการคมนาคมบางส่วนระงับบริการ
นครเกียวโตมีคำสั่งอพยพชาวบ้านกว่า 160,000 คน เนื่องจากคาดว่าจะมีฝนตกหนักมากในวันอาทิตย์ และอาจทำให้น้ำในแม่น้ำเอ่อท้นและดินถล่ม นอกจากนี้ ยังมีคำสั่งอพยพในพื้นที่เมืองอิบารากิ จังหวัดโอซากา ที่ได้รับความเสียหายจากเหตุแผ่นดินไหวเมื่อวันที่ 18 มิถุนายนเนื่องจากสภาพพื้นที่ยังเปราะบางและอาจได้รับผลกระทบจากฝนตกหนัก
ที่จังหวัดเฮียวโงะ คนงานก่อสร้างรายหนึ่งเสียชีวิตเพราะถูกดูดเข้าไปในท่อระบายน้ำ และอีก 2 รายบาดเจ็บ
ภาคเหนือของญี่ปุ่นและพื้นที่โอกินาวาในภาคใต้ของญี่ปุ่นก็จะมีฝนตกหนักเช่นกัน โดยภาคเหนือของญี่ปุ่นจะมีฝนตกหนักมากตั้งแต่เย็นวันพฤหัสบดีที่ 5 กรกฎาคม ส่วนที่โอกินาวาจะมีฝนตกหนักในวันเสาร์ที่ 7
สำนักอุตุนิยมวิทยาของญี่ปุ่นเตือนให้ระวังดินถล่ม น้ำท่วม และน้ำเอ่อล้นจากแม่น้ำ รวมทั้งฟ้าผ่า พายุหมุน และลมกระโชกแรง พร้อมญี่ปุ่นแนะนำให้ประชาชนปฏิบัติตามข้อมูลการอพยพจากทางการท้องถิ่น และย้ายไปยังพื้นที่ปลอดภัย.