สำนักงานการบินพลเรือนแห่งประเทศไทย หรือ CAAT ออกประกาศฉบับที่ 16 / 2564 ลงวันที่ 11 พฤษภาคม 2564 เน้นย้ำสายการบินต้องตรวจสอบ COE ของผู้โดยสารก่อนขึ้นเครื่องบินเข้าไทยอย่างเคร่งครัด โดยระบุว่า
ตามที่กระทรวงการต่างประเทศมีมติระงับการออกหนังสือรับรองการเดินทางเข้าประเทศไทย (Certificate of Entry : COE) ให้กับชาวต่างชาติที่มาจากประเทศปากีสถาน บังกลาเทศ และเนปาล ชั่วคราว มีผลตั้งแต่วันที่ 10 พฤษภาคม 2564 จากการตรวจพบว่าหญิงชาวไทยที่เดินทางกลับมาจากประเทศปากีสถาน และปัจจุบันอยู่ในสถานที่กักกันของรัฐ (State Quarantine) ติดเชื้อโควิด-19 สายพันธุ์อินเดีย
สำนักงานการบินพลเรือนแห่งประเทศไทย (CAAT) ผู้กำกับดูแลเที่ยวบินเข้าประเทศไทย ขอเน้นย้ำสายการบินอีกครั้งในการตรวจสอบ COE ของผู้โดยสารทุกคนก่อนขึ้นเครื่องบินจากประเทศต้นทางทุกประเทศอย่างเคร่งครัด เพื่อให้สอดคล้องกับมาตรการของกระทรวงการต่างประเทศในการคัดกรองบุคคลเข้าประเทศอย่างมีประสิทธิภาพสูงสุด โดยเฉพาะการเดินทางจาก 3 ประเทศดังกล่าวเพื่อเดินทางเข้าประเทศไทย โดย CAAT ได้ออกหนังสือเน้นย้ำสายการบินในการตรวจสอบ COE อย่างเข้มงวด ตั้งแต่วันที่ 4 พฤษภาคม 2564 ที่ผ่านมา ซึ่งหากพบว่ามีผู้โดยสารเดินทางเข้าประเทศโดยไม่มี COE สายการบินจะต้องรับผิดชอบการส่งผู้โดยสารกลับประเทศต้นทางในกรณีที่ไม่สามารถเข้าประเทศไทย หรือต้องดูแลผู้โดยสารจนกว่าจะมีการดำเนินการอย่างหนึ่งอย่างใด
สำนักงานการบินพลเรือนแห่งประเทศไทย ย้ำด้วยว่า ขอให้สายการบินปฏิบัติตามมาตรการที่ได้ประกาศไปอย่างเคร่งครัด หากพบว่ามีการขนส่งผู้โดยสารที่ไม่มี COE CAAT จะดำเนินมาตรการด้านการอนุญาตทำการบินเข้าประเทศต่อไป