พล.อ.ธนะศักดิ์ ปฎิมาประกร รองนายกรัฐมนตรี ระบุว่า จากเหตุระเบิดห้างบิ๊กซีปัตตานีดังกล่าว เจ้าหน้าที่และตำรวจได้ดำเนินการอย่างเต็มที่ แต่อาจยังคงไม่เพียงพอ ดังนั้นจึงขอให้ประชาชนช่วยกันเฝ้าระมัดระวังการก่อเหตุให้มากยิ่งขึ้นอีกทางหนึ่งด้วย โดยเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นไม่เกี่ยวข้องกับการที่ทางการมาเลเซียจับกุมผู้ต้องสงสัยที่คาดว่า มีส่วนพัวพันกับกลุ่มรัฐอิสลาม(ไอเอส) ซึ่งทางการมาเลเซีย ระบุว่า อาจมีส่วนเกี่ยวข้องกับการลักลอบขนอาวุธจากภาคใต้ของไทยให้แก่กลุ่มก่อการร้าย และมีกระแสข่าวว่ามีการหลบหนีเข้ามาที่ไทย แล้วเดินทางออกจากประไทยไปเมื่อวันที่ 21 เม.ย.แล้ว ส่วนสาเหตุการก่อเหตุระเบิดในพื้นที่ชุมชนห้างบิ๊กซี อ.เมืองปัตตานี ครั้งนี้ ให้หน่วยงานความมั่นคงเป็นผู้ชี้แจง