นายศรีสุวรรณ จรรยา นายกสมาคมต่อต้านสภาวะโลกร้อน กับคณะรวม 45 ราย ได้ยื่นฟ้องนายกรัฐมนตรีกับผู้เกี่ยวข้อง ต่อศาลปกครอง เพื่อขอให้ศาลปกครอง 1.มีคำสั่งหรือคำพิพากษาเพิกถอนแผนแม่บทการบริหารจัดการทรัพยากรน้ำ 2.ขอให้ผู้ถูกฟ้องคดีร่วมกันจัดให้มีกระบวนการรับฟังความคิดเห็นฯ (ประชามติ) และ 3.ขอให้ผู้ถูกฟ้องคดีปฏิบัติตามรัฐธรรมนูญฯ พ.ศ. 2550 และกฎหมายที่เกี่ยวข้องก่อนการดำเนินงานโครงการต่างๆ ตามแผนฯ โดยขอให้ศาลปกครองมีคำสั่งไต่สวนฉุกเฉิน และมีมาตรการคุ้มครองชั่วคราว โดยการสั่งระงับการเปิดซองข้อเสนอด้านเทคนิค และซองข้อเสนอด้านราคาจากกลุ่มผู้ประกอบการ ซึ่งผู้ถูกฟ้องคดีกำหนดเปิดรับซองฯ ในวันที่ 3 พฤษภาคม 2556 ไว้เป็นการชั่วคราว