การที่ น.ส.ยิ่งลักษณ์ ชินวัตร นายกรัฐมนตรี ประกาศรับผิดชอบโดยตรงต่อการแก้ไขปัญหาความไม่สงบ ในจังหวัดชายแดนภาคใต้ ทำให้นักวิชาการ และภาคประชาสังคมในพื้นที่ คาดหวังว่าอาจมีส่วนช่วยบูรณาการการทำงานในพื้นที่ของกองอำนวยการรักษาความมั่นคงภายในภาค 4 หรือ กอ.รมน.และศูนย์อำนวยการบริหารจังหวัดชายแดนภาคใต้ หรือ ศอ.บต.ที่อยู่ใต้การกำกับดูแลโดยตรงของนายกรัฐมนตรี
นอกจากนี้ ยังมีความเห็นด้วยว่า นายกรัฐมนตรีถือเป็นผู้มีอำนาจการบริหารสูงสุด สามารถเชื่อมต่อกองทัพได้โดยตรง อาจมีส่วนช่วยการตัดสินใจต่างๆ รวดเร็วยิ่งขึ้น แต่คงต้องมีการดูแลพื้นที่มากกว่านี้ รวมถึงต้องมีความชัดเจนในแนวคิดการลงมือทำงานในพื้นที่ ภายใต้ พ.ร.บ.การบริหารราชการจังหวัดชายแดนภาคใต้ กำหนดให้เลขา ศอ.บต.เป็นข้าราชการระดับ 11 เทียบเท่าปลัดกระทรวง มีฐานะสูงกว่าผู้อำนวยการ กอ.รมน.ภาค 4 หรือแม่ทัพภาค 4 ซึ่งเป็นระดับ 10 ซึ่งทำให้เกิดข้อสังเกตว่า เป็นส่วนหนึ่งที่ทำให้การแก้ไขปัญหาในพื้นที่ มีปัญหาเรื่องการประสานงานกันในพื้นที่
นอกจากนี้ ยังมีความเห็นด้วยว่า นายกรัฐมนตรีถือเป็นผู้มีอำนาจการบริหารสูงสุด สามารถเชื่อมต่อกองทัพได้โดยตรง อาจมีส่วนช่วยการตัดสินใจต่างๆ รวดเร็วยิ่งขึ้น แต่คงต้องมีการดูแลพื้นที่มากกว่านี้ รวมถึงต้องมีความชัดเจนในแนวคิดการลงมือทำงานในพื้นที่ ภายใต้ พ.ร.บ.การบริหารราชการจังหวัดชายแดนภาคใต้ กำหนดให้เลขา ศอ.บต.เป็นข้าราชการระดับ 11 เทียบเท่าปลัดกระทรวง มีฐานะสูงกว่าผู้อำนวยการ กอ.รมน.ภาค 4 หรือแม่ทัพภาค 4 ซึ่งเป็นระดับ 10 ซึ่งทำให้เกิดข้อสังเกตว่า เป็นส่วนหนึ่งที่ทำให้การแก้ไขปัญหาในพื้นที่ มีปัญหาเรื่องการประสานงานกันในพื้นที่
