กระทรวงการต่างประเทศ ได้เผยแพร่ผ่านเว็ปไซต์ ระบุว่า "เมื่อวันที่ 8 มิถุนายน 2554 นายธานี ทองภักดี อธิบดีกรมสารนิเทศและโฆษกกระทรวงการต่างประเทศ ได้ตอบคำถามผู้สื่อข่าวเกี่ยวกับกรณีที่กัมพูชาอ้างว่าไทยละเมิดอธิปไตยเหนือน่านฟ้าของกัมพูชาเมื่อวันที่ 31 พฤษภาคม 1 มิถุนายน และ 3 มิถุนายน 2554 ตามลำดับว่า กระทรวงการต่างประเทศได้มีหนังสือถึงสถานเอกอัครราชทูตกัมพูชาประจำประเทศไทยเกี่ยวกับเรื่องนี้แล้ว ซึ่งระบุว่า รัฐบาลไทยขอปฏิเสธข้อกล่าวหาทั้งปวงของกัมพูชา และแสดงความผิดหวังที่กัมพูชาได้กล่าวหาไทยอีกครั้งหนึ่ง โดยไม่ได้ตรวจสอบข้อเท็จจริงกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้องของฝ่ายไทยในทุกระดับก่อน
รวมทั้งย้ำว่า ประเทศไทยไม่เคยประสงค์ร้ายต่อกัมพูชา และไม่เคยเตรียมการที่จะโจมตีกัมพูชาตามที่กล่าวหา ในทางตรงกันข้าม ประเทศไทยต้องการแก้ไขปัญหากับกัมพูชาโดยสันติและอย่างฉันมิตรผ่านกลไกทวิภาคีที่มีอยู่ ซึ่งเป็นไปตามความประสงค์ของผู้นำประเทศสมาชิกอาเซียน ประเทศไทยต้องการที่จะคงบรรยากาศที่ดีระหว่างทั้งสองประเทศ ซึ่งความพยายามต่าง ๆ ทั้งในระดับทวิภาคีและภูมิภาคก็กำลังดำเนินไปในทิศทางที่เป็นบวก และไทยพร้อมที่จะร่วมมือกับกัมพูชาเพื่อประโยชน์ร่วมกันของประชาชนทั้งสองประเทศ ไทยจึงหวังว่ากัมพูชาจะตอบสนองต่อมิตรภาพและความปรารถนาดีจากฝ่ายไทย
รวมทั้งย้ำว่า ประเทศไทยไม่เคยประสงค์ร้ายต่อกัมพูชา และไม่เคยเตรียมการที่จะโจมตีกัมพูชาตามที่กล่าวหา ในทางตรงกันข้าม ประเทศไทยต้องการแก้ไขปัญหากับกัมพูชาโดยสันติและอย่างฉันมิตรผ่านกลไกทวิภาคีที่มีอยู่ ซึ่งเป็นไปตามความประสงค์ของผู้นำประเทศสมาชิกอาเซียน ประเทศไทยต้องการที่จะคงบรรยากาศที่ดีระหว่างทั้งสองประเทศ ซึ่งความพยายามต่าง ๆ ทั้งในระดับทวิภาคีและภูมิภาคก็กำลังดำเนินไปในทิศทางที่เป็นบวก และไทยพร้อมที่จะร่วมมือกับกัมพูชาเพื่อประโยชน์ร่วมกันของประชาชนทั้งสองประเทศ ไทยจึงหวังว่ากัมพูชาจะตอบสนองต่อมิตรภาพและความปรารถนาดีจากฝ่ายไทย